Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RNF17Q9BXT8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF17Q9BXT8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms