Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms