Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYCP2Q9BX26 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms