Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms