Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UPK3BQ9BT76 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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