Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG101Q9BSB4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms