Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms