Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms