Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms