Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRQ99707 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRQ99707 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRQ99707 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRQ99707 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRQ99707 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRQ99707 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRQ99707 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRQ99707 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRQ99707 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRQ99707 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRQ99707 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRQ99707 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRQ99707 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRQ99707 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRQ99707 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRQ99707 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRQ99707 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRQ99707 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRQ99707 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRQ99707 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRQ99707 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRQ99707 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRQ99707 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MTRQ99707 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MTRQ99707 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRQ99707 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRQ99707 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRQ99707 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRQ99707 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRQ99707 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRQ99707 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRQ99707 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRQ99707 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRQ99707 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRQ99707 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRQ99707 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRQ99707 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRQ99707 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRQ99707 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRQ99707 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRQ99707 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRQ99707 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRQ99707 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRQ99707 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRQ99707 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRQ99707 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRQ99707 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRQ99707 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRQ99707 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRQ99707 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRQ99707 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRQ99707 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRQ99707 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRQ99707 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRQ99707 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRQ99707 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRQ99707 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRQ99707 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRQ99707 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRQ99707 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRQ99707 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRQ99707 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRQ99707 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRQ99707 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRQ99707 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRQ99707 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRQ99707 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRQ99707 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRQ99707 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRQ99707 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRQ99707 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRQ99707 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRQ99707 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRQ99707 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRQ99707 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRQ99707 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRQ99707 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRQ99707 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRQ99707 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRQ99707 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRQ99707 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRQ99707 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRQ99707 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRQ99707 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRQ99707 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRQ99707 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRQ99707 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRQ99707 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRQ99707 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRQ99707 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRQ99707 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRQ99707 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRQ99707 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRQ99707 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRQ99707 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRQ99707 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRQ99707 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRQ99707 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRQ99707 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms