Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDC5LQ99459 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDC5LQ99459 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC5LQ99459 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC5LQ99459 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC5LQ99459 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC5LQ99459 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC5LQ99459 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC5LQ99459 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC5LQ99459 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC5LQ99459 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC5LQ99459 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC5LQ99459 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC5LQ99459 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms