Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R9BQ96SB3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms