Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms