Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms