Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms