Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms