Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms