Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms