Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms