Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms