Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms