Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYTL4Q96C24 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYTL4Q96C24 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms