Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF428Q96B54 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF428Q96B54 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms