Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms