Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms