Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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