Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms