Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms