Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms