Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD12Q8N8I0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD12Q8N8I0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms