Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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