Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTROBQ8N137 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms