Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAPLN4Q86UW8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms