Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
YTHDF3Q7Z739 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
YTHDF3Q7Z739 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
YTHDF3Q7Z739 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
YTHDF3Q7Z739 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
YTHDF3Q7Z739 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
YTHDF3Q7Z739 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
YTHDF3Q7Z739 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
YTHDF3Q7Z739 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
YTHDF3Q7Z739 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms