Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms