Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF550Q7Z398 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF550Q7Z398 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF550Q7Z398 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF550Q7Z398 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF550Q7Z398 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF550Q7Z398 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF550Q7Z398 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF550Q7Z398 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF550Q7Z398 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF550Q7Z398 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF550Q7Z398 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF550Q7Z398 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF550Q7Z398 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF550Q7Z398 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms