Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms