Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms