Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRINP3Q76B58 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms