Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEND4Q6ZU67 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms