Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms