Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms