Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms