Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms