Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms