Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms