Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGMBQ6NW40 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms