Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSAPQ6IQ19 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms