Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
INTS3Q68E01 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms