Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4DIPQ5VU43 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms